علی لاريجانی، که عليرغم استعفا از دبيری شورای عالی امنيت ملی همچنان در تيم مذاکرات اتمی حضور دارد، در مصاحبه و اظهار نظرهای اخيرش اشاراتی خواندنی به اختلافات پشت پرده می کند. او در رم و در پاسخ به خبرنگاران برای اولين بار احتمال برکناری احمدی نژاد را زير پوشش اين جمله طرح کرد: حتی اگر رئيس جمهور تغيير کند، سياست اتمی ايران، بعنوان سياست کلی دنبال خواهد شد.

48 ساعت بعد، در يک اظهار نظر ديگر، مشکل روان پريشی شخص احمدی نژاد را بصورت دو پهلو مطرح کرد و در پاسخ به سئوال تکراری دليل استعفاء، با اشاره غير مستقيم به اظهار نظر احمدی نژاد که گفته بود لاريجانی تصميم شخصی گرفته بود، گفت:

من هر چقدر به خودم نگاه می كنم، مشكل شخصی نمی بينم. مسايل استراتژيك در شورای امنيت ملی بحث می شود كه رئيس آن رئيس جمهور است و زير نظر رهبری اداره می شود.