دكتر ابراهيم يزدی در گفت‌وگوی كوتاهی با خبرگزاری ايسنا، پيرامون مسائل مربوط به جنگ عراق و پيامدهای آن برای ايران گفت:
چنانچه رژيم بعثی صدام به كشتار جمعی در كشورش دست نمی‌زد، زمينه دخالت كشورهای خارجی در خصوص تغيير نظام در عراق را به وجود نمی‌آمد. پس از پايان جنگ، به علت ضرورت تحكيم مبانی سازمان ملل متحد، تغييراتی در چارچوب تحولاتی كه روی داده است، به وقوع خواهد پيوست.
دكتر يزدی در بخش ديگری از صحبت خود به نقض حقوق بشر در كشورهای اسلامی اشاره كرد و بدون ذكر مثال از ايران و جمهوری اسلامی گفت: برخی متفكرين اسلامی علی‌رغم داعيه مسلمانی، به حقوق بشر و دموكراسی، اعتقادی نداشته حتی آن را كفر می‌دانند.
 يزدی ياد‌آور شد: چنانچه طرح گفت‌وگوی تمدنها و آشتی ملی به درستی در ميان اقشار احزاب و گروه‌های سياسی در داخل نظام جمهوری اسلامی ايران پياده شود، می‌توان انتظار داشت كه جهانيان اين ادعای رهبران ما را به عنوان كشوری كه مدعی دموكراسی است، بپذيرند.
وی سياست ايران مبنی بر اينكه از هيچ يك از متخاصمين در اين جنگ - آمريكا و رژيم عراق- حمايت نمی‌كند را سياستی درست ولی ناكافی دانست  يزدی سياست ايران در قبال جنگ عراق را سياست بی‌طرفی منفعل خواند و اظهار عقيده كرد: ايران برای حفظ منافع، مصالح و امنيت ملی در عراق، بايد سياستی بيش از بی‌طرفی، اتخاذ كند.