معصومه شفيعی، همسر اكبر گنجی، در شكايت جديدی از تيم شكنجه دادستان تهران به آيت الله شاهرودی، رئيس قوه قضائيه فاش ساخت:

«در ملاقات اخير اينجانب با همسرم _ آقای اكبر گنجي_ در روز جمعه، 20/8/84، ايشان نكته بسيار مهم، نگران كننده و قابل تأملی را يادآور شد. او گفت كه در روز ضرب و شتم و شكنجه در بيمارستان ميلاد، همان تيم عملياتی ويژه دادستانی كه مسئوليت ضرب و شتم را به عهده داشتند به وی  گفته بودند: "فكر نكن از دست ما جان سالم به در می‌بری، بيرون هم كه بروی يا خودمان تو را می‌كُشيم يا دوستانی كه در بيرون داريم؛ همان كاری كه با سعيد حجاريان كرديم...".

با توجه به بيان جملات تكان دهنده فوق از سوی مأموران حاكميت و با توجه به سابقه كشتن منتقدان و روشنفكران در طی سال‌های اخير و عدم معرفی آمران و عاملان اصلی اين قتل‌ها، من و خانواده‌ام نسبت به زندگی، امنيت و سلامتی آقای گنجی، بسيار نگران و مضطربيم.

از آنجا كه جنابعالی مسئوليت خطير رياست دستگاه قضايی و بالطبع تيم عملياتی ويژه دادستانی را نيز به عهده داريد و قانوناً مسئول پيگيری شكايات و پاسخگوی مستقيم و نهايی هر نوع اقدام غيرقانونی و غيرانسانی اشخاص و سازمان‌های زيرمجموعه خود هستيد، لذا شكايت خويش را از تيم عملياتی ويژه دادستانی و آمران آنها كه آقای گنجی را تهديد به ترور نموده‌اند، تقديم حضرتعالی می‌كنم.

بديهی است كه در موارد حساس اين چنينی نه تنها اينجانب و خانواده‌ام بلكه افكار عمومی نيز به شدت خواهان پيگيری موضوع و معرفی تروريست‌هايی هستند كه پشت نقاب قانون وماموران دستگاه قضائی خود را پنهان نموده اند.

عدم پيگيری فوری اين شكايت به منزله بی‌توجهی به تأمين و تضمين امنيت داخلی بوده و مسئوليت‌های بسياری را متوجه حضرتعالی خواهد كرد.