بلافاصله پس از ترور مقدسی دو تشكل شناخته شده دانشجوئی بيمناك از زمينه چينی‌های پشت اين ترور برای بگيروببند و بازگشت به دهه 60، در دو اطلاعيه جداگانه آن را محكوم كردند.

 سازمان دانش آموختگان ايران اسلامي(ادوار تحكيم وحدت) در محكوميت اين ترور در بيانيه خود نوشت: جامعه ايران هزينه‌های سنگينی به علت حاكم شدن فضای خشونت در كشور پرداخته است و هنوز نيز فشار سنگين خشونت و ترور را تحمل می‌كند.

سازمان دانش آموختگان ايران اسلامي(ادوار تحكيم وحدت)  ضمن محكوم كردن خشونت و ترور قاضی مقدس، انزجار خود را نسبت اين موضوع اعلام می‌دارد.

دفتر تحكيم وحدت نيز در اطلاعيه خود نوشت:

خشونت و ترور به شهادت تاريخ هيچگاه به تاسيس و تثبيت دموكراسی منجر نگشته است. جريانات دموكراتيك همواره مخالف برقراری منطق خشونت در عرصه سياست بوده و خشونت را سم مهلك برای گذار به دموكراسی دانسته اند. دفتر تحكيم وحدت ضمن ابراز انزجار از ترور قاضی مقدس ، اين عمل غير انسانی را با هرانگيزه و هدفی كه صورت گرفته محكوم می‌نمايد.