آيت الله گلپايگانى را بتدريج در قم جلو كشيده اند تا كم كم او را در حوزه علميه بر صدر نشانند و مرجع كنند. او كه زمينه می‌چينند تا بلكه گرداننده مجلس خبرگان آينده شود، همانگونه می‌انديشد كه مصباح يزدی. اب

جديدترين نظرات وی را، در آستانه رفتن خاتمی و آمدن احمدی نژاد كه در مطبوعات منتشر شده و سيمای جمهوری اسلامی پخش كرده بخوانيد:

آيت الله گلپايگانی در ديدار گروهى از دست اندركاران نشريه هيات(همان تشكل هائی كه مداحان و روضه خوان ها می‌گردانند و وزير اطلاعات بر مشكوك بودن فعاليت آنها انگشت گذاشته است- پيك نت) رزمندگان اسلام، اختلاط موجود بين زن و مرد در جامعه را برخلاف دستورات اسلامى دانست. وى در اين ديدار گفت: يكى از امتيازات جامعه اسلامى بر جوامع ديگر، نبود اختلاط زن و مرد است يعنى مرد نامحرم نبايد با زن نامحرم در يك جا بنشينند و مانند دو مرد و يا دو زن با هم سخن بگويند، البته هر دو آنها در اجتماع حضور دارند و وظايف خود را انجام مى دهند ولى جداى از يكديگر، اختلاط زن و مرد با اسلام تطبيق ندارد.