تنها كتاب منتشرنشده‌ی محمدجعفر پوينده، از قربانيان قتل‌های زنجيره‌ای با عنوان «در شناخت انديشه‌ی لوسين گلدمن»  به زودی توسط نشركتاب مهناز منتشر می‌شود.

پس از درگذشت پوينده در سال 77، هفت اثر از او منتشر شده كه عبارت است از: تحولات خانواده، آرزوهای برباد رفته (بالزاك)، هگل و انديشه‌ فلسفی در روسيه، زبان‌شناسی اجتماعی، درآمدی بر جامعه‌شناسی، آموزش و پرورش، مبارزات فلسفی در شوروی و تاريخ تحليلی فلسفه‌ی معاصر شوروی كه توسط نشر نی، انتشارات نقش‌جهان و نشر ماهی عرضه شده‌اند.

بعد از قتل پوينده، امتياز يك چاپ مجموعه‌ آثار او به نشر چشمه سپرده شد كه تا كنون 14 جلد از مجموع 28 اثر پوينده توسط اين مؤسسه‌ انتشاراتی به چاپ رسيده است. جامعه، فرهنگ، ادبيات، جامعه‌شناسی ادبيات، اگر فرزند دختر داريد...، آموزش تربيت كودكان، مكتب بوداپست، جامعه‌شناسی رمان، تاريخ مبارزات فلسفی شوروی، درآمدی بر جامعه‌شناسی ادبيات، پيكار با تبعيض جنسی، درآمدی بر هگل، پيردختر (بالزاك)، سودای مكالمه، خنده، آزادی، مقوله‌ی فلسفی معاصر شوروی و راه زندگی.

خشايار ديهيمی كه وكالت چاپ آثار پوينده را از طرف خانواده‌ او برعهده دارد، درباره‌ ادامه‌ی انتشار اين مجموعه‌ آثار توضيح داد: زمانی كه چاپ مجموعه را با نشر چشمه شروع كرديم، وزارت ارشاد با ما قراردادی بست و از طريق خريد 500 نسخه از هر كتاب، به ما كمك می‌كرد؛ اما با تغييری كه در معاونت امور فرهنگی وزارتخانه به‌وجود آمد، مديريت جديد با ادامه‌ی همكاری موافقت نكرد و هيچ كمكی نشد كه درنتيجه به خاطر نبود بودجه، بقيه‌ی كتاب‌های آماده‌ برای انتشار، در اين مجموعه در نيامد.

او ادامه‌ی انتشار اين كتاب‌ها را به داشتن بودجه و سرمايه‌گذاری كسی در اين زمينه منوط دانست.

ديگر كتاب‌هايی كه از محمدجعفر پوينده منتشر شده، عبارت است از: گوسيك رباخوار (بالزاك)، سپيده‌دمان تاريخ، بورژوازی، سياست ملی كتاب، راهنمای توسعه‌ی كتاب و كتابخوانی، پاسخ درباره‌ حقوق بشر و اعلاميه‌ی جهانی حقوق بشر و تاريخچه‌ آن.

پوينده 17 خرداد 1333 در يزد به دنيا آمد و آذرماه سال 1377 و درجريان قتل‌های زنجيره‌ای پيكر او، چند روز پس از ربوده شدن در حوالی تهران پيدا شد. عامل قتل اين پژوهشگر و مترجم، عوامل خودسری از وزارت اطلاعات معرفی شدند.